Tiếp đến, bạn bấm nút Browse ở mục Right Folder rồi chọn thư mục lưu trữ những dữ liệu quan trọng đó, bấm Next để chuyển sang bước tiếp theo. Ở bước What do you want to do, bạn chọn một trong ba cách thức đồng bộ dữ liệu:

- Synchronize: chương trình sẽ đồng bộ dữ liệu hai chiều và sẽ đổi tên, xóa những tập tin trùng lặp với tập tin mới cập nhật.

- Echo: chương trình chỉ chuyển dữ liệu từ thư mục cần sao lưu sang thư mục lưu trữ. Lưu ý, các tập tin trên thư mục lưu trữ trùng tên với tập tin mới chuyển vào sẽ bị xóa.

- Contribute: giống như cách thức Echo nhưng các tập tin cũ trùng tên với tập tin mới trên thư mục lưu trữ chỉ bị đổi tên. Sau khi chọn xong, bạn bấm Next để tiếp tục. Đến bước Name your foder pair, bạn nhập tên thư mục lưu trữ (tên thư mục này được hiển thị trong khung bên trái giao diện chính của chương trình) vào ô rồi bấm Finish. Bạn thực hiện thao tác tương tự như vậy cho những cặp thư mục đồng bộ khác.

Ngoài ra, SyncToy còn cung cấp một số tùy chọn nâng cao như cho phép hoặc không cho phép sao lưu một định dạng nào đó, không đồng bộ những tập tin đặc biệt... Để thực hiện, bạn bấm Change options bên dưới cặp thư mục đồng bộ. Hộp thoại xuất hiện có hai ô Files to include (nhập định dạng tập tin cho phép đồng bộ), Files to exclude (nhập định dạng tập tin không cho phép đồng bộ). Bạn nhập định dạng tập tin đầy đủ (có ghi *. ở trước), ví dụ: *.doc và dùng dấu chấm phẩy (;) để ngăn cách giữa các định dạng. Nếu bạn đánh dấu chọn vào 3 ô Exclude read-only fi les, Exclude hidden fi les và Exclude system fi les thì chương trình sẽ không đồng bộ các tập tin có thuộc tính chỉ đọc, tập tin ẩn và tập tin hệ thống.

Một thủ thuật không thể bỏ qua khi sử dụng SyncToy là bạn có thể sử dụng dòng lệnh để thực hiện đồng bộ các cặp thư mục một cách tự động thay vì phải tự tay bấm nút Run ở giao diện chính ở từng cặp thư mục. Đầu tiên, hãy tải về đoạn mã lệnh trong tập tin www. mediafi re.com/?nxzsfa1agpe8c51 rồi sao chép vào Notepad và lưu lại thành tập tin autobackup.wsf. Lưu ý, bạn cần thay đổi tên thư mục phù hợp với thiết lập trên SyncToy. Kế đến, sử dụng tác vụ lập lịch trình của Windows để khởi chạy đoạn mã đã tạo. Để thực hiện, bạn vào Control Panel, mở nhóm công cụ Administrative Tools, khởi động công cụ Task Scheduler, bấm Create Task. Ở thẻ General, bạn điền vào các thông tin Name - tên, Description - chú thích.

Ở thẻ Triggers, bạn bấm New rồi chọn On a Schedule ở mục Begin a task, và các tùy chọn: Daily ở mục Settings, Start at 3 a.m, Recur every 1 days, Repeat task every 6 hour. Ở thẻ Action, bạn bấm New rồi chọn Start a program ở mục Action, bấm nút Browse ở trường Program/script và duyệt đến tập tin autobackup.wsf.